“香港—东莞国际空港中心”项目作为《粤港合作框架协议》重点工作，将香港国际机场空运货物的报关、安检及航空打板等核心功能前置到东莞港操作，再采用驳船海运至香港机场码头，随后空运至全球各地，成功实现全球首创跨关境海空联运模式。

2022年初，香港第五轮疫情爆发，供港物资陆路通道受阻，东莞港务集团及时开通“莞港水运专线”，解决莞企的燃眉之急。自2022年2月22日首条航线开通以来，“莞港水运专线”累计服务企业超2400家，运行4875个班次，完成进出口集装箱25.9万标箱，进出口货物重量159.3万吨，进出口总货值突破1000亿元。

2021年7月，受新冠肺炎疫情影响，珠三角主要欧美航线枢纽港持续塞港延误、停航跳港、缺箱严重，东莞企业饱受海运“出货难”、成本高昂的困扰。东莞港务集团创新实施了包船出口模式，挂靠欧洲、地中海、加拿大、美国等国家和地区，共开通23条包船航线，累计出口99航次，带动新增外贸出口额近200亿元。

紧抓RCEP实施的机遇，布局“东盟快航”近洋精品航线，常态化运营9条近洋航线，覆盖RCEP成员国主要港口，为东莞制造精准提供“两港一航”定制化精品航线服务。

携手盐田港打造“莞盐组合港”，在组合港模式下，客户将货物交到东莞港视同交到盐田港，可以对接盐田港近百条远洋直航航线，以“借船出海”实现“莞货莞出”。